Kronični ezofagitis, u pravilu, razvija se iz akutnog ezofagitisa i praktički se temelji na istim etiološkim čimbenicima. Mogu se karakterizirati stvaranjem ulkusa koji ne zacjeljuju, pojavom dugotrajnih upalnih procesa s ožiljnom stenozom, tumorima. Kronični ezofagitis može biti i nespecifičan i specifičan (tuberkuloza, sifilis, aktinomikoza).