Specifična dijagnostika hepatitisa D temelji se na otkrivanju markera aktivne replikacije oba virusa: HBV, HDV. Od prvih dana žutice u krvnom serumu detektiraju se HBsAg, anti-HBV IgM u visokom titru, HBe antigen, HDAg i/ili anti-delta (anti-delta IgM). Anti-delta IgM se proizvodi već u akutnom razdoblju i služi kao glavni marker delta infekcije.